La flore intestinale, également appelée microbiote intestinal, est reconnue comme un acteur majeur dans la santé digestive, immunitaire et métabolique. Elle se compose de milliards de micro-organismes vivant principalement dans le côlon.
Les probiotiques sont des micro-organismes vivants bénéfiques, qui font l’objet de nombreuses recherches scientifiques visant à mieux comprendre leur interaction avec la flore intestinale.
Dans un contexte où les troubles digestifs sont fréquents, mieux connaitre les effets des probiotiques intestinaux et la façon de les intégrer de façon responsable dans la vie quotidienne est essentiel.

Résumé en 4 points

  • La flore intestinale est un écosystème complexe jouant un rôle central dans la digestion, l’immunité et la communication intestin-cerveau.
  • Les probiotiques intestinaux, appartenant principalement aux genres Lactobacillus, Bifidobacterium et Saccharomyces, interagissent avec le microbiote et peuvent moduler son équilibre.
  • Certaines souches ont fait l’objet d’évaluations dans le cadre du syndrome de l’intestin irritable et ont mis en évidence des effets sur certains symptômes digestifs, avec une variabilité des résultats selon les souches étudiées et les caractéristiques individuelles.
  • Les compléments alimentaires à base de probiotiques peuvent constituer un accompagnement utile pour enrichir le microbiote et soutenir sa diversité, lorsqu’ils sont utilisés de manière responsable, en complément d’une alimentation équilibrée et d’un mode de vie sain.

Qu’est-ce que la flore intestinale et pourquoi est-elle importante ?

La flore intestinale (aujourd’hui appelée microbiote intestinal) est composée de milliards de micro-organismes (bactéries, levures, etc.) vivant dans le tube digestif.
La flore intestinale participe à :

  • La digestion (fermentation) des fibres et de certains glucides non digestibles, ainsi qu’au métabolisme de nutriments et composés alimentaires, tels que certains glucides complexes, des vitamines du groupe B et K, des résidus protéiques et des polyphénols.
  • La protection contre les agents pathogènes (qui nous rendent malades) via le maintien de la barrière intestinale.
  • La modulation de l’immunité (1). Les probiotiques du microbiote jouent un rôle clé dans l’immunité intestinale.
  • La communication intestin-cerveau (2).

Un microbiote déséquilibré est associé à divers troubles digestifs, métaboliques ou inflammatoires.

Un déséquilibre de la flore intestinale (on parle de dysbiose) est fréquemment observé par exemple dans le syndrome de l’intestin irritable et les maladies intestinales chroniques inflammatoires (maladie de Crohn et rectocolite hémorragique) (3).

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Sources alimentaires de probiotiques naturels
Les yaourts, les laits fermentés, le kéfir, la choucroute, le miso et le tempeh sont des sources alimentaires de probiotiques naturels.

Probiotiques intestinaux : définition scientifique

Selon l’Organisation mondiale de la santé, les probiotiques sont des « micro-organismes vivants qui, lorsqu’ils sont administrés en quantités adéquates, confèrent un bénéfice pour la santé de l’hôte ».

Les souches probiotiques étudiées appartiennent principalement aux genres Lactobacillus, Bifidobacterium ou Saccharomyces. Les effets observés dans les études dépendent de la souche, de la dose et du contexte d’utilisation, ce qui explique des résultats parfois hétérogènes d’une étude à l’autre (4).

Probiotiques naturels pour la flore intestinal : quels aliments adopter ?

Certains aliments fermentés contiennent naturellement des micro-organismes vivants.
Parmi les aliments les plus riches en probiotiques : yaourts et laits fermentés, kéfir, choucroute crue, miso et tempeh.

AlimentProbiotiques principaux (simplifiés)
YaourtBactéries lactiques (LactobacillusStreptococcus thermophilus)
KéfirBactéries lactiques (LactobacillusLactococcus) + levures
ChoucrouteBactéries lactiques (LactobacillusLeuconostoc)
KombuchaLevures + bactéries acétiques
MisoChampignon (Aspergillus oryzae) + bactéries salées
TempehChampignon (Rhizopus oligosporus) + bactéries secondaires

Tableau des principaux probiotiques présents dans les aliments : yaourt, kéfir, choucroute, miso, tempeh…

Favoriser ces aliments permet d’enrichir naturellement le microbiote et de contribuer à sa diversité.

Certains compléments alimentaires apportent également des probiotiques soigneusement sélectionnés.

Comment fonctionnent les probiotiques dans les intestins ?

  1. Ils peuvent entrer en compétition avec des bactéries déjà présentes dans l’intestin, influençant la répartition naturelle des différentes populations microbiennes.
  2. Ils augmentent la production d’acide lactique, favorisant un pH moins favorable aux microbes nuisibles.
  3. Ils peuvent interagir avec la muqueuse intestinale, ce qui s’inscrit dans les mécanismes naturels de communication entre l’écosystème intestinal et les cellules impliquées dans les réponses immunitaires locales (5).

Probiotiques et intestin irritable : état des connaissances

Le syndrome de l’intestin irritable (SII) est un trouble digestif fonctionnel caractérisé par des douleurs abdominales et des troubles du transit (diarrhées, constipation, ballonnements, flatulences).
Des études montrent que les personnes atteintes de SII (ou côlon irritable) présentent fréquemment des différences de composition du microbiote par rapport aux sujets sains (6).

Les probiotiques peuvent-ils aider ?

Plusieurs essais cliniques et méta-analyses ont évalué l’intérêt de certaines souches probiotiques dans le cadre du SII. Une méta-analyse notamment, indique que les probiotiques, considérés globalement, sont associés à une amélioration de certains symptômes digestifs chez une partie des patients (7).

Les conseils NHCO pour intégrer les probiotiques de manière responsable

  • Privilégier les aliments fermentés et les varier.
  • Privilégier les prébiotiques (fibres ou composés végétaux non digestibles), nourriture des probiotiques.
  • Limiter les aliments ultra-transformés et l’alcool, qui peuvent déséquilibrer le microbiote.
  • Les compléments alimentaires à base de probiotiques, comme L-Intexyl, s’utilisent comme un accompagnement, dans le cadre d’une alimentation variée et d’un mode de vie sain.
  • Choisir des compléments indiquant clairement les souches et le nombre d’UFC (bactéries vivantes), et commencer par une dose adaptée, généralement entre 1 et 10 milliards par jour selon le produit.
  • Les conserver selon les recommandations (température, éviter la lumière directe, la chaleur, l’humidité, refermer après usage, respecter la date de péremption car les bactéries vivantes diminuent avec le temps).
  • En cas de troubles digestifs persistants, demander l’avis d’un professionnel de santé.

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Sources : 

(1) Hooper LV et al., Interactions between the microbiota and the immune system, Science, 2012, 336(6086):1268-73.
(2) Wang HX et al., Gut Microbiota-brain Axis, Chin Med J (Engl), 2016, 129(19):2373-80.
(3) Lal S et al., Gut microbiome dysbiosis in inflammatory bowel disease, Prog Mol Biol Transl Sci, 2022, 192(1):179-204.
(4) McFarland LV et al., Strain-Specificity and Disease-Specificity of Probiotic Efficacy: A Systematic Review and Meta-Analysis, Front Med (Lausanne), 2018, 5:124.
(5) Plaza-Diaz J et al., Mechanisms of Action of Probiotics, Adv Nutr, 2019, 10(suppl_1):S49-S66.
(6) Pittayanon R et al., Gut Microbiota in Patients With Irritable Bowel Syndrome-A Systematic Review, Gastroenterology, 2019, 157(1):97-108.
(7) Goodoory VC et al., Efficacy of Probiotics in Irritable Bowel Syndrome: Systematic Review and Meta-analysis, Gastroenterology, 2023, 165(5):1206-18.

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